Förklara följande begrepp: replikationsbubbla och replikationsgaffel.
Var är ett origin of replication?
Hur skiljer sig DNA-syntes åt på leading och lagging strand?
Vilken funktion har 3’ till 5’-exonukleas-aktiviteten som återfinns hos många DNA-polymeraser?
Vad är processivitet? Hur kan en sliding clamp stimulera processivitet?
Vad är ett primas? När behövs ett sådant enzym?
Hur går “Okazaki fragment maturation” till i våra celler?
Vilka aktiviteter är förknippade med exonukleas och endonukleas?### Förklara begreppen replikationsbubbla och replikationsgaffel
Replikationsbubbla är området där DNA öppnats kring ett origin; replikationsgaffel är varje Y-formad ände där DNA syntetiseras.
Var är ett origin of replication?
En specifik DNA-sekvens där replikation initieras och DNA öppnas.
Hur skiljer sig DNA-syntes på leading och lagging strand?
Leading strand syntetiseras kontinuerligt; lagging strand syntetiseras diskontinuerligt som Okazaki-fragment.
Vilken funktion har 3’→5’-exonukleasaktiviteten hos DNA-polymeraser?
Proofreading; avlägsnar felinkorporerade nukleotider och ökar noggrannheten.
Vad är processivitet och hur stimulerar sliding clamp detta?
Processivitet är hur många nukleotider som adderas per bindning; sliding clamp håller polymeraset kvar på DNA.
Vad är ett primas och när behövs det?
Ett RNA-polymeras som syntetiserar primers; behövs för att starta DNA-syntes.
Hur går Okazaki fragment maturation till?
RNA-primer tas bort, gap fylls med DNA och fragmenten ligeras ihop.
Vilka aktiviteter har exonukleas respektive endonukleas?
Exonukleas tar bort nukleotider från ändar; endonukleas klyver inom en nukleotidkedja.
Hur fungerar helikas?
Använder ATP för att separera DNA-strängarna genom att bryta vätebindningar.
Vilken roll spelar enkelsträngsbindande proteiner och vad heter de i våra celler?
Stabiliserar ssDNA och förhindrar återparning; i eukaryoter heter de RPA.
Varför bildas positiva supercoils och hur tas de bort?
De bildas framför replikationsgaffeln vid uppvridning; topoisomeraser avlägsnar dem genom att klyva och återligera DNA.
Hur fungerar helikas?
Vilken roll spelar enkelsträngsbindande proteiner? Vad heter detta protein i våra celler?
Varför bildas positiva supercoils? Vilka enzymer kan ta bort supercoils och hur?